更新时间:2024-09-26
RACE技术是采用PCR 技术由已知的部分cDNA 顺序来扩增出完整cDNA5’和3’末端,是一种简便而有效的方法, 又被称为锚定 PCR (anchoredPCR)和单边PCR(one2side PCR)。
RACE技术实验原理
RACE技术是采用PCR 技术由已知的部分cDNA 顺序来扩增出完整cDNA5’和3’末端,是一种简便而有效的方法, 又被称为锚定 PCR (anchoredPCR)和单边PCR(one2side PCR)。
3'RACE
利用mRNA的3'末端的poly(A)尾巴作为一个引物结合位点,以连有SMART寡核营酸序列通用接头引物的Oligo(dT)30MN作为锁定引物反转录合成标准*链cDNA.然后用一个基因特异引物GSP1(gene specific primer,GSP)作为上游引物,用一个含有部分接头序列的通用引物UPM(universal primer,UPM)作为下游引物,以cDNA*链为模板,进行PCR循环,把目的基因3' 末端的基因片
段扩增出来。
5'RACE
先利用mRNA的3'末端的poly(A)尾巴作为一个引物结合位点,以Oligo(dT)30MN作为锁定引物在反转录酶MMLV作用下,反转录合成标准*链cDNA.利用该反转录酶具有的末端转移酶活性,在反转录达到*链的5'末端时自动加上3-5个(dC)残基,退火后(dC)残基与含有SMART寡核苷酸序列Oliogo(dG)通用接头引物配对后,转换为以SMART序列为模板继续延伸而连上通用接头(见Figure 2 )。然后用一个含有部分接头序列的通用引物UPM(universal primer,UPM)作为上游引物,用一个基因特异引物2(GSP 2 genespecific primer,GSP)作为下游引物,以SMART*链cDNA为模板,进行PCR循环,把目的基因5'末端的c基因 片段扩增出来。终,从2个有相互重叠序列的3'/ 5'-RACE产物中获得全长cDNA,或者通过分析RACE产物的3'和5'端序列,合成相应引物扩增出全长cDNA。
实验流程:
1、总RNA提取以及cDNA反转录
2、根据已知序列设计引物,以cDNA模板进行扩增,验证序列正确性
3、RACE 扩增,并测序,使用锚定PCR(AnchoredPCR)与巢式PCR(Nested PCR)相结合的方法,分别进行3'末端和5'末端RACE并对其产物进行测序
4、根据测序结果拼接目的基因全长cDNA序列
5、将RACE产物进行TA克隆用于后续研究(可根据客户要求自行选择)
服务优势
采用进口试剂,确保实验准确性
较同类产品方法更快速,便捷
丰富的项目经验,超过500例的成功案例
提供全套的后续生物信息学分析服务(可根据客户要求提供个性化分析服务)
服务流程
1、确认客户提供的序列信息
2、评估RACE实验可行性
3、确认样本信息
4、根据客户提供的信息设计好实验方案,销售做出报价合同
4、客户确定无误后签订《沃森生物-RACE检测服务合同》,并签字(或盖章)
5、支付预付款,服务正式启动
6、根据合同实验方案开展实验
8、实验结束后,发送初步实验报告
9、支付实验尾款
10、提供详细实验报告,完成实验项目
材料提交说明
实验样品
1、组织或者细胞:提供尽可能多的新鲜组织或细胞样品(包括3个技术重复),组织样品不少于200 mg,细胞至少107个
2、RNA样品:3’ RACE:Total RNA>15μg;5’ RACE:Total RNA>25μg(注:OD260/OD280在1.9-2.1之间,完整性好)
序列信息:
1、大于200bp的已知序列(请注明已知序列的5’ 端及3’ 端):如果已知序列比较短,建议先进行3’ RACE再进行5’ RACE,以提高实验的成功率
2、实验数据和参考文献:这将会帮助我们更好地理解您的实验背景,有利于实验的顺利进行
结果交付
实验结题报告:包括实验步骤,引物信息,实验过程 PCR产物照片,全长序列拼接结果;
测序原始数据:测序彩色波形图、碱基序列图;
实验产物:引物、PCR产物、测序用质粒(限产生克隆测序的情况)。
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